Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
EXOSC2Q13868 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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