Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTAN1Q13813 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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