Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
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SHROOM2Q13796 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
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SHROOM2Q13796 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
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SHROOM2Q13796 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHROOM2Q13796 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
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