Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TUBB3Q13509 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB3Q13509 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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