Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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