Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms