Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms