Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RIGQ13278 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RIGQ13278 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RIGQ13278 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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