Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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