Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2BQ13224 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
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