Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC8Q13216 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC8Q13216 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC8Q13216 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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ERCC8Q13216 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC8Q13216 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC8Q13216 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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ERCC8Q13216 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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ERCC8Q13216 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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ERCC8Q13216 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERCC8Q13216 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERCC8Q13216 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERCC8Q13216 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERCC8Q13216 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERCC8Q13216 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERCC8Q13216 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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