Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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SEMA3BQ13214 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3BQ13214 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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