Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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