Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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