Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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