Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF5AQ12840 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF5AQ12840 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms