Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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