Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TROQ12816 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TROQ12816 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TROQ12816 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TROQ12816 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TROQ12816 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TROQ12816 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TROQ12816 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TROQ12816 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
TROQ12816 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
TROQ12816 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
TROQ12816 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
TROQ12816 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TROQ12816 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TROQ12816 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TROQ12816 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TROQ12816 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TROQ12816 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TROQ12816 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TROQ12816 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TROQ12816 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TROQ12816 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TROQ12816 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TROQ12816 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TROQ12816 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TROQ12816 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TROQ12816 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TROQ12816 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TROQ12816 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TROQ12816 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TROQ12816 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TROQ12816 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TROQ12816 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TROQ12816 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TROQ12816 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TROQ12816 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TROQ12816 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TROQ12816 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TROQ12816 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TROQ12816 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TROQ12816 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TROQ12816 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TROQ12816 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
TROQ12816 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TROQ12816 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TROQ12816 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TROQ12816 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TROQ12816 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TROQ12816 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms