Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YBL053WYBL053W 375 nt1.54□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 SKI3YPR189W 4299 nt1.54□□□□□ -2.16 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOR019WYOR019W 2193 nt1.54□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 DNF3YMR162C 4971 nt1.53□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.53□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 SBE22YHR103W 2559 nt1.53□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.53□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 CTF4YPR135W 2784 nt1.53□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.53□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.52□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 SPO24YPR036W-A 204 nt1.52□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.52□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 EMC5YIL027C 426 nt1.51□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 YJL022WYJL022W 309 nt1.51□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 YNL205CYNL205C 423 nt1.51□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 ADR1YDR216W 3972 nt1.51□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 KCS1YDR017C 3153 nt1.51□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 YCS4YLR272C 3531 nt1.5□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 snR85snR85 171 nt1.5□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 RPS30BYOR182C 192 nt1.5□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 YPL044CYPL044C 549 nt1.5□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 RAD50YNL250W 3939 nt1.5□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 ALY2YJL084C 3141 nt1.5□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 IRA1YBR140C 9279 nt1.5□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 snR48snR48 113 nt1.49□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 POL5YEL055C 3069 nt1.48□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 SMC4YLR086W 4257 nt1.48□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 PAA1YDR071C 576 nt1.48□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 COX12YLR038C 252 nt1.48□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 YLR422WYLR422W 5799 nt1.47□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 TTI1YKL033W 3117 nt1.47□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 UFD2YDL190C 2886 nt1.47□□□□□ -2.17
PUF2Q12221 MEC1YBR136W 7107 nt1.46□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 MDS3YGL197W 4464 nt1.46□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 PAN2YGL094C 3348 nt1.46□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 PMD1YER132C 5262 nt1.45□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 APL1YJR005W 2103 nt1.45□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 YDL206WYDL206W 2289 nt1.45□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 SXM1YDR395W 2835 nt1.45□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 BST1YFL025C 3090 nt1.45□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 CHS1YNL192W 3396 nt1.45□□□□□ -2.18 RIP-Chip
PUF2Q12221 SLX4YLR135W 2247 nt1.44□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 KAP122YGL016W 3246 nt1.44□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.44□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 YOR102WYOR102W 351 nt1.44□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 snR14snR14 160 nt1.44□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.43□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 TRM732YMR259C 4263 nt1.43□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 MSH3YCR092C 3057 nt1.42□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.42□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.42□□□□□ -2.18
PUF2Q12221 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.4□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 YNL211CYNL211C 261 nt1.4□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 SPC110YDR356W 2835 nt1.4□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 MMS4YBR098W 2076 nt1.39□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.39□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 SSK2YNR031C 4740 nt1.38□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.37□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 CCH1YGR217W 6120 nt1.37□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 YAR009CYAR009C 3591 nt1.37□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 PRP5YBR237W 2550 nt1.37□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 LAA1YJL207C 6045 nt1.36□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 YLL054CYLL054C 2532 nt1.36□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 PIK1YNL267W 3201 nt1.36□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 FYV8YGR196C 2454 nt1.35□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 PET127YOR017W 2403 nt1.35□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.35□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.35□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 FIG2YCR089W 4830 nt1.35□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.34□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.34□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.34□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.34□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.34□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.34□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.34□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.34□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.34□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 RSM22YKL155C 1887 nt1.34□□□□□ -2.19
PUF2Q12221 EST2YLR318W 2655 nt1.33□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 CDC25YLR310C 4770 nt1.33□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 BFR2YDR299W 1605 nt1.33□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 NUP188YML103C 4968 nt1.32□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 HKR1YDR420W 5409 nt1.31□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 AZF1YOR113W 2745 nt1.31□□□□□ -2.2 RIP-Chip
PUF2Q12221 COX5BYIL111W 456 nt1.31□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.31□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.31□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 EAF1YDR359C 2949 nt1.31□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 SET3YKR029C 2256 nt1.31□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 YGL182CYGL182C 324 nt1.3□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 YLL020CYLL020C 306 nt1.3□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 SEC21YNL287W 2808 nt1.3□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 YGR130CYGR130C 2451 nt1.3□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 APL3YBL037W 3078 nt1.3□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 SWI4YER111C 3282 nt1.29□□□□□ -2.2 RIP-Chip
PUF2Q12221 CMC4YMR194C-B 222 nt1.29□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 STO1YMR125W 2586 nt1.29□□□□□ -2.2 RIP-Chip
PUF2Q12221 CDC39YCR093W 6327 nt1.29□□□□□ -2.2
PUF2Q12221 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.28□□□□□ -2.2
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