Protein–RNA interactions for Protein: Q12220

DIP2, U3 small nucleolar RNA-associated protein 12, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 943 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DIP2Q12220 STE6YKL209C 3873 nt3.8□□□□□ -1.8
DIP2Q12220 NNF2YGR089W 2811 nt3.8□□□□□ -1.8
DIP2Q12220 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt3.78□□□□□ -1.8
DIP2Q12220 PIK1YNL267W 3201 nt3.78□□□□□ -1.8
DIP2Q12220 FAR11YNL127W 2862 nt3.77□□□□□ -1.81
DIP2Q12220 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt3.77□□□□□ -1.81
DIP2Q12220 MSH6YDR097C 3729 nt3.75□□□□□ -1.81
DIP2Q12220 MDN1YLR106C 14733 nt3.75□□□□□ -1.81
DIP2Q12220 UTP21YLR409C 2820 nt3.75□□□□□ -1.81
DIP2Q12220 RIF1YBR275C 5751 nt3.74□□□□□ -1.81
DIP2Q12220 MGA2YIR033W 3342 nt3.73□□□□□ -1.81
DIP2Q12220 HIR3YJR140C 4947 nt3.71□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 SPA2YLL021W 4401 nt3.71□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 SSM4YIL030C 3960 nt3.7□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt3.69□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 ANS1YHR126C 480 nt3.69□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt3.69□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 HSL1YKL101W 4557 nt3.69□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 FLO11YIR019C 4104 nt3.69□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 RTT101YJL047C 2529 nt3.69□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 YLR422WYLR422W 5799 nt3.68□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 BRE1YDL074C 2103 nt3.68□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 POL2YNL262W 6669 nt3.67□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 EMC5YIL027C 426 nt3.67□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 DRS2YAL026C 4068 nt3.66□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 KIP1YBL063W 3336 nt3.66□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 SKI7YOR076C 2244 nt3.66□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 TOP2YNL088W 4287 nt3.66□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt3.66□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 CHC1YGL206C 4962 nt3.66□□□□□ -1.82
DIP2Q12220 CDC25YLR310C 4770 nt3.65□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 RAD50YNL250W 3939 nt3.65□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 YEL025CYEL025C 3567 nt3.64□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 RPL41AYDL184C 78 nt3.64□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 ESL2YKR096W 3588 nt3.64□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 SAC3YDR159W 3906 nt3.63□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 BPT1YLL015W 4680 nt3.63□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 BEM3YPL115C 3387 nt3.63□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 GIP3YPL137C 3831 nt3.62□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 GCN1YGL195W 8019 nt3.62□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 YIL169CYIL169C 2988 nt3.62□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.61□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 YCS4YLR272C 3531 nt3.61□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 SLH1YGR271W 5904 nt3.6□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt3.59□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt3.59□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 MSB2YGR014W 3921 nt3.59□□□□□ -1.83
DIP2Q12220 KRE33YNL132W 3171 nt3.59□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt3.58□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 SIR4YDR227W 4077 nt3.58□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 ARP8YOR141C 2646 nt3.57□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 YDR209CYDR209C 414 nt3.57□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 KOG1YHR186C 4674 nt3.57□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt3.56□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 RGC1YPR115W 3252 nt3.55□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 DNA2YHR164C 4569 nt3.55□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt3.54□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt3.54□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 INO80YGL150C 4470 nt3.53□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 RAV1YJR033C 4074 nt3.53□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 AI1Q0050 2505 nt3.53□□□□□ -1.84
DIP2Q12220 SAP1YER047C 2694 nt3.52□□□□□ -1.85
DIP2Q12220 RPA190YOR341W 4995 nt3.51□□□□□ -1.85
DIP2Q12220 SRB8YCR081W 4284 nt3.51□□□□□ -1.85
DIP2Q12220 snR38snR38 95 nt3.51□□□□□ -1.85
DIP2Q12220 snR70snR70 164 nt3.49□□□□□ -1.85
DIP2Q12220 PKH3YDR466W 2697 nt3.49□□□□□ -1.85
DIP2Q12220 EST1YLR233C 2100 nt3.49□□□□□ -1.85
DIP2Q12220 ULP2YIL031W 3105 nt3.48□□□□□ -1.85
DIP2Q12220 YML054C-AYML054C-A 159 nt3.47□□□□□ -1.85
DIP2Q12220 YPL216WYPL216W 3309 nt3.47□□□□□ -1.85
DIP2Q12220 PET127YOR017W 2403 nt3.45□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 SEC8YPR055W 3198 nt3.45□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 STH1YIL126W 4080 nt3.45□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 snR69snR69 101 nt3.45□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 CIN8YEL061C 3003 nt3.45□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.44□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 NIP1YMR309C 2439 nt3.44□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 YSP1YHR155W 3687 nt3.43□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 HER1YOR227W 3741 nt3.43□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 PRP8YHR165C 7242 nt3.43□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 TFC3YAL001C 3483 nt3.43□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 STO1YMR125W 2586 nt3.43□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 PRP16YKR086W 3216 nt3.42□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 snR14snR14 160 nt3.42□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 KAP122YGL016W 3246 nt3.42□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 PMR1YGL167C 2853 nt3.41□□□□□ -1.86
DIP2Q12220 RDS3YPR094W 324 nt3.4□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 NST1YNL091W 3723 nt3.39□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 DYN1YKR054C 12279 nt3.39□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 SPF1YEL031W 3648 nt3.39□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 SPO14YKR031C 5052 nt3.38□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 SXM1YDR395W 2835 nt3.37□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 SEC3YER008C 4011 nt3.37□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 SNQ2YDR011W 4506 nt3.36□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.36□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.36□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.36□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.36□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.36□□□□□ -1.87
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