Protein–RNA interactions for Protein: Q12028

APL4, AP-1 complex subunit gamma-1, yeastyeast

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL4Q12028 CDC39YCR093W 6327 nt1.32□□□□□ -2.2
APL4Q12028 STO1YMR125W 2586 nt1.32□□□□□ -2.2
APL4Q12028 CDC36YDL165W 576 nt1.32□□□□□ -2.2
APL4Q12028 YOR302WYOR302W 78 nt1.32□□□□□ -2.2
APL4Q12028 BEM2YER155C 6504 nt1.31□□□□□ -2.2
APL4Q12028 AIM44YPL158C 2277 nt1.31□□□□□ -2.2
APL4Q12028 REV3YPL167C 4515 nt1.3□□□□□ -2.2
APL4Q12028 ECM12YHR021W-A 456 nt1.3□□□□□ -2.2
APL4Q12028 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.3□□□□□ -2.2
APL4Q12028 LAA1YJL207C 6045 nt1.28□□□□□ -2.2
APL4Q12028 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.28□□□□□ -2.2
APL4Q12028 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.28□□□□□ -2.2
APL4Q12028 EAF1YDR359C 2949 nt1.28□□□□□ -2.2
APL4Q12028 NST1YNL091W 3723 nt1.28□□□□□ -2.21
APL4Q12028 CLU1YMR012W 3834 nt1.28□□□□□ -2.21
APL4Q12028 NUP192YJL039C 5052 nt1.27□□□□□ -2.21
APL4Q12028 NUP145YGL092W 3954 nt1.27□□□□□ -2.21
APL4Q12028 RAD9YDR217C 3930 nt1.27□□□□□ -2.21
APL4Q12028 STB6YKL072W 2301 nt1.27□□□□□ -2.21
APL4Q12028 SPG3YDR504C 384 nt1.27□□□□□ -2.21
APL4Q12028 YLL020CYLL020C 306 nt1.27□□□□□ -2.21
APL4Q12028 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.27□□□□□ -2.21
APL4Q12028 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.26□□□□□ -2.21
APL4Q12028 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.26□□□□□ -2.21
APL4Q12028 YKU70YMR284W 1809 nt1.26□□□□□ -2.21
APL4Q12028 SEC3YER008C 4011 nt1.25□□□□□ -2.21
APL4Q12028 JLP2YMR132C 627 nt1.25□□□□□ -2.21
APL4Q12028 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.25□□□□□ -2.21
APL4Q12028 OLI1Q0130 231 nt1.24□□□□□ -2.21
APL4Q12028 APQ12YIL040W 417 nt1.24□□□□□ -2.21
APL4Q12028 NUP157YER105C 4176 nt1.23□□□□□ -2.21
APL4Q12028 YDL196WYDL196W 330 nt1.23□□□□□ -2.21
APL4Q12028 YNL211CYNL211C 261 nt1.23□□□□□ -2.21
APL4Q12028 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.23□□□□□ -2.21
APL4Q12028 ROM2YLR371W 4071 nt1.22□□□□□ -2.21
APL4Q12028 WAR1YML076C 2835 nt1.22□□□□□ -2.21
APL4Q12028 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.22□□□□□ -2.21
APL4Q12028 ASE1YOR058C 2658 nt1.2□□□□□ -2.22
APL4Q12028 KAP120YPL125W 3099 nt1.2□□□□□ -2.22
APL4Q12028 MSH3YCR092C 3057 nt1.19□□□□□ -2.22
APL4Q12028 BLI1YKL061W 342 nt1.19□□□□□ -2.22
APL4Q12028 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.19□□□□□ -2.22
APL4Q12028 ISD11YER048W-A 285 nt1.18□□□□□ -2.22
APL4Q12028 PAM16YJL104W 450 nt1.18□□□□□ -2.22
APL4Q12028 CMC4YMR194C-B 222 nt1.18□□□□□ -2.22
APL4Q12028 YOR345CYOR345C 351 nt1.18□□□□□ -2.22
APL4Q12028 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.18□□□□□ -2.22
APL4Q12028 NOP9YJL010C 2001 nt1.18□□□□□ -2.22
APL4Q12028 PAA1YDR071C 576 nt1.17□□□□□ -2.22
APL4Q12028 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.17□□□□□ -2.22
APL4Q12028 APL1YJR005W 2103 nt1.17□□□□□ -2.22
APL4Q12028 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.17□□□□□ -2.22
APL4Q12028 SCC2YDR180W 4482 nt1.16□□□□□ -2.22
APL4Q12028 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.16□□□□□ -2.22
APL4Q12028 GEA2YEL022W 4380 nt1.15□□□□□ -2.23
APL4Q12028 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.15□□□□□ -2.23
APL4Q12028 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.15□□□□□ -2.23
APL4Q12028 HAL9YOL089C 3093 nt1.15□□□□□ -2.23
APL4Q12028 SIP4YJL089W 2490 nt1.14□□□□□ -2.23
APL4Q12028 ULI1YFR026C 510 nt1.12□□□□□ -2.23
APL4Q12028 COX12YLR038C 252 nt1.12□□□□□ -2.23
APL4Q12028 RPS30BYOR182C 192 nt1.12□□□□□ -2.23
APL4Q12028 TTI1YKL033W 3117 nt1.12□□□□□ -2.23
APL4Q12028 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.11□□□□□ -2.23
APL4Q12028 YPL044CYPL044C 549 nt1.11□□□□□ -2.23
APL4Q12028 DOP1YDR141C 5097 nt1.1□□□□□ -2.23
APL4Q12028 SMC1YFL008W 3678 nt1.1□□□□□ -2.23
APL4Q12028 VAM6YDL077C 3150 nt1.09□□□□□ -2.23
APL4Q12028 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.09□□□□□ -2.23
APL4Q12028 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.09□□□□□ -2.23
APL4Q12028 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.09□□□□□ -2.23
APL4Q12028 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.09□□□□□ -2.23
APL4Q12028 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.09□□□□□ -2.23
APL4Q12028 PRP16YKR086W 3216 nt1.08□□□□□ -2.24
APL4Q12028 BUD3YCL014W 4911 nt1.08□□□□□ -2.24
APL4Q12028 COY1YKL179C 2040 nt1.08□□□□□ -2.24
APL4Q12028 YJR029WYJR029W 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
APL4Q12028 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
APL4Q12028 YDL073WYDL073W 2955 nt1.07□□□□□ -2.24
APL4Q12028 SPT7YBR081C 3999 nt1.06□□□□□ -2.24
APL4Q12028 RPL26BYGR034W 384 nt1.06□□□□□ -2.24
APL4Q12028 ANS1YHR126C 480 nt1.06□□□□□ -2.24
APL4Q12028 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.06□□□□□ -2.24
APL4Q12028 snR46snR46 197 nt1.06□□□□□ -2.24
APL4Q12028 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.05□□□□□ -2.24
APL4Q12028 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.05□□□□□ -2.24
APL4Q12028 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.05□□□□□ -2.24
APL4Q12028 BFR2YDR299W 1605 nt1.04□□□□□ -2.24
APL4Q12028 YLR282CYLR282C 342 nt1.04□□□□□ -2.24
APL4Q12028 PMP1YCR024C-A 123 nt1.03□□□□□ -2.24
APL4Q12028 YEL014CYEL014C 306 nt1.03□□□□□ -2.24
APL4Q12028 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.03□□□□□ -2.24
APL4Q12028 snR190snR190 190 nt1.03□□□□□ -2.24
APL4Q12028 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.02□□□□□ -2.25
APL4Q12028 COX5BYIL111W 456 nt1.02□□□□□ -2.25
APL4Q12028 IML1YJR138W 4755 nt1.01□□□□□ -2.25
APL4Q12028 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1□□□□□ -2.25
APL4Q12028 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1□□□□□ -2.25
APL4Q12028 YJL150WYJL150W 303 nt1□□□□□ -2.25
APL4Q12028 PAU24YBR301W 363 nt1□□□□□ -2.25
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