Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCBP1Q09161 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms