Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms