Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms