Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CKAP4Q07065 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms