Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms