Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms