Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUCB1Q02818 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms