Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPCQ01831 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPCQ01831 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPCQ01831 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPCQ01831 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPCQ01831 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPCQ01831 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPCQ01831 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPCQ01831 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPCQ01831 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPCQ01831 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
XPCQ01831 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPCQ01831 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPCQ01831 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPCQ01831 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPCQ01831 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPCQ01831 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPCQ01831 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPCQ01831 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPCQ01831 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
XPCQ01831 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPCQ01831 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPCQ01831 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPCQ01831 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPCQ01831 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPCQ01831 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPCQ01831 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPCQ01831 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPCQ01831 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPCQ01831 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPCQ01831 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPCQ01831 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPCQ01831 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPCQ01831 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPCQ01831 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPCQ01831 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XPCQ01831 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XPCQ01831 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XPCQ01831 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XPCQ01831 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XPCQ01831 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
XPCQ01831 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPCQ01831 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPCQ01831 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPCQ01831 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPCQ01831 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
XPCQ01831 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms