Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms