Protein–RNA interactions for Protein: Q01448

HPC2, Histone promoter control protein 2, yeastyeast

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HPC2Q01448 BNR1YIL159W 4128 nt2.64□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 GYP5YPL249C 2685 nt2.63□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 LHS1YKL073W 2646 nt2.63□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 BNI1YNL271C 5862 nt2.63□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 HSL1YKL101W 4557 nt2.63□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 VPS13YLL040C 9435 nt2.62□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 UFD2YDL190C 2886 nt2.62□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 YGL182CYGL182C 324 nt2.62□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.62□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 YJR039WYJR039W 3366 nt2.62□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 IRC8YJL051W 2469 nt2.62□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 MYO4YAL029C 4416 nt2.61□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.61□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.6□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 POL5YEL055C 3069 nt2.6□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 UTP8YGR128C 2142 nt2.6□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 FLO11YIR019C 4104 nt2.6□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 TOF1YNL273W 3717 nt2.59□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 EMC5YIL027C 426 nt2.59□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 RAD50YNL250W 3939 nt2.59□□□□□ -1.99
HPC2Q01448 ALY2YJL084C 3141 nt2.58□□□□□ -2
HPC2Q01448 SPF1YEL031W 3648 nt2.58□□□□□ -2
HPC2Q01448 RSM22YKL155C 1887 nt2.58□□□□□ -2
HPC2Q01448 QCR9YGR183C 201 nt2.57□□□□□ -2
HPC2Q01448 YLL020CYLL020C 306 nt2.57□□□□□ -2
HPC2Q01448 PAN2YGL094C 3348 nt2.57□□□□□ -2
HPC2Q01448 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.56□□□□□ -2
HPC2Q01448 MMS4YBR098W 2076 nt2.56□□□□□ -2
HPC2Q01448 BFR2YDR299W 1605 nt2.55□□□□□ -2
HPC2Q01448 snR45snR45 172 nt2.55□□□□□ -2
HPC2Q01448 SVL3YPL032C 2478 nt2.54□□□□□ -2
HPC2Q01448 STB6YKL072W 2301 nt2.54□□□□□ -2
HPC2Q01448 COA6YMR244C-A 315 nt2.54□□□□□ -2
HPC2Q01448 TFC3YAL001C 3483 nt2.54□□□□□ -2
HPC2Q01448 UBR2YLR024C 5619 nt2.53□□□□□ -2
HPC2Q01448 USO1YDL058W 5373 nt2.52□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 TOR2YKL203C 7425 nt2.52□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 TRA1YHR099W 11235 nt2.52□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 ATG9YDL149W 2994 nt2.52□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.52□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 TBS1YBR150C 3285 nt2.51□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 PDR8YLR266C 2106 nt2.51□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 SEC31YDL195W 3822 nt2.5□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 RCO1YMR075W 2055 nt2.5□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 COX5BYIL111W 456 nt2.5□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.5□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.5□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 snR39BsnR39B 96 nt2.5□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 SMC1YFL008W 3678 nt2.49□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 YOL098CYOL098C 3114 nt2.48□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.48□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 YAR009CYAR009C 3591 nt2.48□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 SLX4YLR135W 2247 nt2.48□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.47□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 MGA2YIR033W 3342 nt2.47□□□□□ -2.01
HPC2Q01448 BPH1YCR032W 6504 nt2.46□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 INO80YGL150C 4470 nt2.44□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 SMC4YLR086W 4257 nt2.44□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 SKI3YPR189W 4299 nt2.43□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 EAF1YDR359C 2949 nt2.43□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 snR81snR81 201 nt2.43□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 SEC16YPL085W 6588 nt2.43□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 CSF1YLR087C 8877 nt2.42□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 YLR419WYLR419W 4308 nt2.42□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 TAH1YCR060W 336 nt2.42□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 snR14snR14 160 nt2.42□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 YML002WYML002W 2214 nt2.41□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 BRE1YDL074C 2103 nt2.41□□□□□ -2.02
HPC2Q01448 YOR093CYOR093C 4947 nt2.4□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 KCS1YDR017C 3153 nt2.39□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 YMR045CYMR045C 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.39□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 YCS4YLR272C 3531 nt2.37□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 MYO2YOR326W 4725 nt2.37□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 RGA1YOR127W 3024 nt2.35□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 YLR422WYLR422W 5799 nt2.35□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt2.35□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 IRC20YLR247C 4671 nt2.35□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 DNF1YER166W 4716 nt2.35□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 NOP9YJL010C 2001 nt2.34□□□□□ -2.03
HPC2Q01448 KAP122YGL016W 3246 nt2.34□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 RTP1YMR185W 2946 nt2.33□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 SEC21YNL287W 2808 nt2.32□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 STO1YMR125W 2586 nt2.32□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 NUP157YER105C 4176 nt2.31□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 snR62snR62 100 nt2.31□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 YLR041WYLR041W 321 nt2.31□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 TMA7YLR262C-A 195 nt2.31□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.31□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 SET3YKR029C 2256 nt2.31□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 COG6YNL041C 2520 nt2.3□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 FAB1YFR019W 6837 nt2.3□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 UFD4YKL010C 4452 nt2.29□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 FYV10YIL097W 1551 nt2.29□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 HUG1YML058W-A 207 nt2.29□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 KAP120YPL125W 3099 nt2.29□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 YLR232WYLR232W 348 nt2.28□□□□□ -2.04
HPC2Q01448 WAR1YML076C 2835 nt2.27□□□□□ -2.05
HPC2Q01448 MON2YNL297C 4911 nt2.27□□□□□ -2.05
HPC2Q01448 NUP192YJL039C 5052 nt2.27□□□□□ -2.05
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