Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDLBPQ00341 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms