Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms