Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HPCAP84074 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPCAP84074 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPCAP84074 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPCAP84074 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPCAP84074 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPCAP84074 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPCAP84074 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPCAP84074 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPCAP84074 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPCAP84074 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPCAP84074 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPCAP84074 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPCAP84074 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPCAP84074 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPCAP84074 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPCAP84074 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPCAP84074 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPCAP84074 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPCAP84074 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms