Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP2P63027 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms