Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM3P62310 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM3P62310 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM3P62310 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM3P62310 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM3P62310 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM3P62310 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM3P62310 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM3P62310 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM3P62310 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM3P62310 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM3P62310 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM3P62310 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM3P62310 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms