Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2FP61218 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms