Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms