Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX16P57768 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX16P57768 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX16P57768 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX16P57768 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX16P57768 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX16P57768 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX16P57768 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX16P57768 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX16P57768 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX16P57768 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX16P57768 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX16P57768 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX16P57768 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX16P57768 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms