Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP107P57740 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP107P57740 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP107P57740 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP107P57740 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP107P57740 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP107P57740 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP107P57740 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP107P57740 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP107P57740 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP107P57740 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms