Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTBP2P56545 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTBP2P56545 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTBP2P56545 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTBP2P56545 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTBP2P56545 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTBP2P56545 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTBP2P56545 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTBP2P56545 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTBP2P56545 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTBP2P56545 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTBP2P56545 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTBP2P56545 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms