Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLE2P56282 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLE2P56282 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLE2P56282 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLE2P56282 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLE2P56282 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLE2P56282 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLE2P56282 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLE2P56282 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLE2P56282 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLE2P56282 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLE2P56282 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLE2P56282 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLE2P56282 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLE2P56282 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLE2P56282 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLE2P56282 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLE2P56282 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
POLE2P56282 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms