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Protein–RNA interactions for Protein: P52918
MSN5, Protein MSN5, yeast
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1,224 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
MSN5
P52918
tM(CAU)Q2
tM(CAU)Q2
78 nt
2.51
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
YOR161W-A
YOR161W-A
81 nt
2.51
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
IRA2
YOL081W
9240 nt
2.51
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
SPF1
YEL031W
3648 nt
2.5
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
HSL1
YKL101W
4557 nt
2.49
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
CSF1
YLR087C
8877 nt
2.49
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
TOF1
YNL273W
3717 nt
2.49
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
TFC3
YAL001C
3483 nt
2.49
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
YBR072C-A
YBR072C-A
162 nt
2.49
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
ADR1
YDR216W
3972 nt
2.49
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
EAF1
YDR359C
2949 nt
2.49
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
IRC20
YLR247C
4671 nt
2.49
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
KOG1
YHR186C
4674 nt
2.48
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
COG6
YNL041C
2520 nt
2.48
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
NUP157
YER105C
4176 nt
2.48
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
BNI1
YNL271C
5862 nt
2.48
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
INO80
YGL150C
4470 nt
2.48
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
YOL083C-A
YOL083C-A
141 nt
2.47
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
MYO4
YAL029C
4416 nt
2.46
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
TRA1
YHR099W
11235 nt
2.46
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
CTR9
YOL145C
3234 nt
2.46
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
SEC31
YDL195W
3822 nt
2.45
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
YKL100W-A
YKL100W-A
90 nt
2.45
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
YNL266W
YNL266W
420 nt
2.45
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
SEC16
YPL085W
6588 nt
2.45
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
BIR1
YJR089W
2865 nt
2.44
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
SSD1
YDR293C
3753 nt
2.44
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
HUG1
YML058W-A
207 nt
2.44
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
KAP120
YPL125W
3099 nt
2.44
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
TRL1
YJL087C
2484 nt
2.44
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
YDR034C-A
YDR034C-A
177 nt
2.43
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
YDR210W
YDR210W
228 nt
2.43
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
YER172C-A
YER172C-A
381 nt
2.43
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
YHR180W-A
YHR180W-A
183 nt
2.43
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
YJL052C-A
YJL052C-A
120 nt
2.43
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
IRE1
YHR079C
3348 nt
2.42
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
COX5B
YIL111W
456 nt
2.42
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
SYH1
YPL105C
2550 nt
2.42
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
RSM22
YKL155C
1887 nt
2.41
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
YJL127W-A
YJL127W-A
117 nt
2.41
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
YBL071C-B
YBL071C-B
99 nt
2.41
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
CDC60
YPL160W
3273 nt
2.41
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
RAV1
YJR033C
4074 nt
2.41
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
FRK1
YPL141C
2598 nt
2.41
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
TBS1
YBR150C
3285 nt
2.41
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
PET309
YLR067C
2898 nt
2.4
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
YOL098C
YOL098C
3114 nt
2.4
□□□□□ -2.02
MSN5
P52918
POL5
YEL055C
3069 nt
2.4
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
TUS1
YLR425W
3924 nt
2.4
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
COA6
YMR244C-A
315 nt
2.4
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
SEC1
YDR164C
2175 nt
2.38
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
DNF1
YER166W
4716 nt
2.37
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
PEP1
YBL017C
4740 nt
2.37
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
RGA1
YOR127W
3024 nt
2.37
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
SET3
YKR029C
2256 nt
2.37
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
SFB2
YNL049C
2631 nt
2.36
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
YPR097W
YPR097W
3222 nt
2.36
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
HIR3
YJR140C
4947 nt
2.36
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
RTP1
YMR185W
2946 nt
2.35
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
SEY1
YOR165W
2331 nt
2.35
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
BRE1
YDL074C
2103 nt
2.35
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
YJR039W
YJR039W
3366 nt
2.35
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
YML002W
YML002W
2214 nt
2.34
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
TIM9
YEL020W-A
264 nt
2.34
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
SPO24
YPR036W-A
204 nt
2.34
□□□□□ -2.03
MSN5
P52918
SEC21
YNL287W
2808 nt
2.34
□□□□□ -2.04
MSN5
P52918
UFD4
YKL010C
4452 nt
2.33
□□□□□ -2.04
MSN5
P52918
TOR2
YKL203C
7425 nt
2.33
□□□□□ -2.04
MSN5
P52918
NUP192
YJL039C
5052 nt
2.32
□□□□□ -2.04
MSN5
P52918
BPH1
YCR032W
6504 nt
2.32
□□□□□ -2.04
MSN5
P52918
YLR232W
YLR232W
348 nt
2.32
□□□□□ -2.04
MSN5
P52918
FAB1
YFR019W
6837 nt
2.32
□□□□□ -2.04
MSN5
P52918
GCN2
YDR283C
4980 nt
2.31
□□□□□ -2.04
MSN5
P52918
YGR146C-A
YGR146C-A
162 nt
2.3
□□□□□ -2.04
MSN5
P52918
YBL100W-C
YBL100W-C
120 nt
2.29
□□□□□ -2.04
MSN5
P52918
TRM3
YDL112W
4311 nt
2.28
□□□□□ -2.04
MSN5
P52918
FYV10
YIL097W
1551 nt
2.27
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
RPS26A
YGL189C
360 nt
2.27
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
YLR041W
YLR041W
321 nt
2.27
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
YMR272W-B
YMR272W-B
108 nt
2.27
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
DGR1
YNL130C-A
147 nt
2.27
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
YOL164W-A
YOL164W-A
183 nt
2.27
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
SMC1
YFL008W
3678 nt
2.27
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
YGR240C-A
YGR240C-A
201 nt
2.26
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
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YDR371C-A
105 nt
2.25
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
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YDR097C
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2.25
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
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YJL047C
2529 nt
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□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
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2.23
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
YOR093C
YOR093C
4947 nt
2.23
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
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YBR196C-A
150 nt
2.23
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
snR53
snR53
91 nt
2.23
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
UTP21
YLR409C
2820 nt
2.23
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
NUT1
YGL151W
3399 nt
2.23
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
RAD50
YNL250W
3939 nt
2.23
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
SXM1
YDR395W
2835 nt
2.23
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
PAN2
YGL094C
3348 nt
2.22
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
SAC3
YDR159W
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2.22
□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
YAR009C
YAR009C
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□□□□□ -2.05
MSN5
P52918
MMS4
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2.21
□□□□□ -2.06
MSN5
P52918
YLR419W
YLR419W
4308 nt
2.21
□□□□□ -2.06
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