Protein–RNA interactions for Protein: P52918

MSN5, Protein MSN5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSN5P52918 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.51□□□□□ -2.01
MSN5P52918 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.51□□□□□ -2.01
MSN5P52918 IRA2YOL081W 9240 nt2.51□□□□□ -2.01
MSN5P52918 SPF1YEL031W 3648 nt2.5□□□□□ -2.01
MSN5P52918 HSL1YKL101W 4557 nt2.49□□□□□ -2.01
MSN5P52918 CSF1YLR087C 8877 nt2.49□□□□□ -2.01
MSN5P52918 TOF1YNL273W 3717 nt2.49□□□□□ -2.01
MSN5P52918 TFC3YAL001C 3483 nt2.49□□□□□ -2.01
MSN5P52918 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt2.49□□□□□ -2.01
MSN5P52918 ADR1YDR216W 3972 nt2.49□□□□□ -2.01
MSN5P52918 EAF1YDR359C 2949 nt2.49□□□□□ -2.01
MSN5P52918 IRC20YLR247C 4671 nt2.49□□□□□ -2.01
MSN5P52918 KOG1YHR186C 4674 nt2.48□□□□□ -2.01
MSN5P52918 COG6YNL041C 2520 nt2.48□□□□□ -2.01
MSN5P52918 NUP157YER105C 4176 nt2.48□□□□□ -2.01
MSN5P52918 BNI1YNL271C 5862 nt2.48□□□□□ -2.01
MSN5P52918 INO80YGL150C 4470 nt2.48□□□□□ -2.01
MSN5P52918 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt2.47□□□□□ -2.01
MSN5P52918 MYO4YAL029C 4416 nt2.46□□□□□ -2.02
MSN5P52918 TRA1YHR099W 11235 nt2.46□□□□□ -2.02
MSN5P52918 CTR9YOL145C 3234 nt2.46□□□□□ -2.02
MSN5P52918 SEC31YDL195W 3822 nt2.45□□□□□ -2.02
MSN5P52918 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.45□□□□□ -2.02
MSN5P52918 YNL266WYNL266W 420 nt2.45□□□□□ -2.02
MSN5P52918 SEC16YPL085W 6588 nt2.45□□□□□ -2.02
MSN5P52918 BIR1YJR089W 2865 nt2.44□□□□□ -2.02
MSN5P52918 SSD1YDR293C 3753 nt2.44□□□□□ -2.02
MSN5P52918 HUG1YML058W-A 207 nt2.44□□□□□ -2.02
MSN5P52918 KAP120YPL125W 3099 nt2.44□□□□□ -2.02
MSN5P52918 TRL1YJL087C 2484 nt2.44□□□□□ -2.02
MSN5P52918 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt2.43□□□□□ -2.02
MSN5P52918 YDR210WYDR210W 228 nt2.43□□□□□ -2.02
MSN5P52918 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.43□□□□□ -2.02
MSN5P52918 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.43□□□□□ -2.02
MSN5P52918 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.43□□□□□ -2.02
MSN5P52918 IRE1YHR079C 3348 nt2.42□□□□□ -2.02
MSN5P52918 COX5BYIL111W 456 nt2.42□□□□□ -2.02
MSN5P52918 SYH1YPL105C 2550 nt2.42□□□□□ -2.02
MSN5P52918 RSM22YKL155C 1887 nt2.41□□□□□ -2.02
MSN5P52918 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.41□□□□□ -2.02
MSN5P52918 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt2.41□□□□□ -2.02
MSN5P52918 CDC60YPL160W 3273 nt2.41□□□□□ -2.02
MSN5P52918 RAV1YJR033C 4074 nt2.41□□□□□ -2.02
MSN5P52918 FRK1YPL141C 2598 nt2.41□□□□□ -2.02
MSN5P52918 TBS1YBR150C 3285 nt2.41□□□□□ -2.02
MSN5P52918 PET309YLR067C 2898 nt2.4□□□□□ -2.02
MSN5P52918 YOL098CYOL098C 3114 nt2.4□□□□□ -2.02
MSN5P52918 POL5YEL055C 3069 nt2.4□□□□□ -2.03
MSN5P52918 TUS1YLR425W 3924 nt2.4□□□□□ -2.03
MSN5P52918 COA6YMR244C-A 315 nt2.4□□□□□ -2.03
MSN5P52918 SEC1YDR164C 2175 nt2.38□□□□□ -2.03
MSN5P52918 DNF1YER166W 4716 nt2.37□□□□□ -2.03
MSN5P52918 PEP1YBL017C 4740 nt2.37□□□□□ -2.03
MSN5P52918 RGA1YOR127W 3024 nt2.37□□□□□ -2.03
MSN5P52918 SET3YKR029C 2256 nt2.37□□□□□ -2.03
MSN5P52918 SFB2YNL049C 2631 nt2.36□□□□□ -2.03
MSN5P52918 YPR097WYPR097W 3222 nt2.36□□□□□ -2.03
MSN5P52918 HIR3YJR140C 4947 nt2.36□□□□□ -2.03
MSN5P52918 RTP1YMR185W 2946 nt2.35□□□□□ -2.03
MSN5P52918 SEY1YOR165W 2331 nt2.35□□□□□ -2.03
MSN5P52918 BRE1YDL074C 2103 nt2.35□□□□□ -2.03
MSN5P52918 YJR039WYJR039W 3366 nt2.35□□□□□ -2.03
MSN5P52918 YML002WYML002W 2214 nt2.34□□□□□ -2.03
MSN5P52918 TIM9YEL020W-A 264 nt2.34□□□□□ -2.03
MSN5P52918 SPO24YPR036W-A 204 nt2.34□□□□□ -2.03
MSN5P52918 SEC21YNL287W 2808 nt2.34□□□□□ -2.04
MSN5P52918 UFD4YKL010C 4452 nt2.33□□□□□ -2.04
MSN5P52918 TOR2YKL203C 7425 nt2.33□□□□□ -2.04
MSN5P52918 NUP192YJL039C 5052 nt2.32□□□□□ -2.04
MSN5P52918 BPH1YCR032W 6504 nt2.32□□□□□ -2.04
MSN5P52918 YLR232WYLR232W 348 nt2.32□□□□□ -2.04
MSN5P52918 FAB1YFR019W 6837 nt2.32□□□□□ -2.04
MSN5P52918 GCN2YDR283C 4980 nt2.31□□□□□ -2.04
MSN5P52918 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.3□□□□□ -2.04
MSN5P52918 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt2.29□□□□□ -2.04
MSN5P52918 TRM3YDL112W 4311 nt2.28□□□□□ -2.04
MSN5P52918 FYV10YIL097W 1551 nt2.27□□□□□ -2.05
MSN5P52918 RPS26AYGL189C 360 nt2.27□□□□□ -2.05
MSN5P52918 YLR041WYLR041W 321 nt2.27□□□□□ -2.05
MSN5P52918 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.27□□□□□ -2.05
MSN5P52918 DGR1YNL130C-A 147 nt2.27□□□□□ -2.05
MSN5P52918 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt2.27□□□□□ -2.05
MSN5P52918 SMC1YFL008W 3678 nt2.27□□□□□ -2.05
MSN5P52918 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt2.26□□□□□ -2.05
MSN5P52918 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt2.25□□□□□ -2.05
MSN5P52918 MSH6YDR097C 3729 nt2.25□□□□□ -2.05
MSN5P52918 RTT101YJL047C 2529 nt2.23□□□□□ -2.05
MSN5P52918 ALY2YJL084C 3141 nt2.23□□□□□ -2.05
MSN5P52918 YOR093CYOR093C 4947 nt2.23□□□□□ -2.05
MSN5P52918 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.23□□□□□ -2.05
MSN5P52918 snR53snR53 91 nt2.23□□□□□ -2.05
MSN5P52918 UTP21YLR409C 2820 nt2.23□□□□□ -2.05
MSN5P52918 NUT1YGL151W 3399 nt2.23□□□□□ -2.05
MSN5P52918 RAD50YNL250W 3939 nt2.23□□□□□ -2.05
MSN5P52918 SXM1YDR395W 2835 nt2.23□□□□□ -2.05
MSN5P52918 PAN2YGL094C 3348 nt2.22□□□□□ -2.05
MSN5P52918 SAC3YDR159W 3906 nt2.22□□□□□ -2.05
MSN5P52918 YAR009CYAR009C 3591 nt2.22□□□□□ -2.05
MSN5P52918 MMS4YBR098W 2076 nt2.21□□□□□ -2.06
MSN5P52918 YLR419WYLR419W 4308 nt2.21□□□□□ -2.06
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