Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK7P50613 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK7P50613 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK7P50613 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK7P50613 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK7P50613 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK7P50613 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK7P50613 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK7P50613 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK7P50613 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK7P50613 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK7P50613 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK7P50613 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK7P50613 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK7P50613 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms