Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPFP49454 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPFP49454 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPFP49454 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms