Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC34P49427 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC34P49427 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC34P49427 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC34P49427 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC34P49427 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC34P49427 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC34P49427 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC34P49427 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC34P49427 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC34P49427 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC34P49427 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms