Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI2P48788 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms