Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A3P48751 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms