Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms