Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms